Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxa13Q62424 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms