Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms