Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms