Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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