Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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