Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms