Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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