Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms