Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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