Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
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