Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
RhoP15409 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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