Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.9 ms