Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm3415J3QMS8 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm3415J3QMS8 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms