Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms