Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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Spocd1B1ASB6 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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Spocd1B1ASB6 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Spocd1B1ASB6 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Spocd1B1ASB6 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Spocd1B1ASB6 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Spocd1B1ASB6 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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