Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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