Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Usp12Q9D9M2 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp12Q9D9M2 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp12Q9D9M2 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp12Q9D9M2 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp12Q9D9M2 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp12Q9D9M2 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp12Q9D9M2 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms