Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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