Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 AC125020.1-201ENSMUST00000220137 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Slc30a6-201ENSMUST00000024870 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Snord88c-201ENSMUST00000116853 90 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm43145-201ENSMUST00000198963 628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 AC134900.1-201ENSMUST00000216575 266 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Klk1b4-201ENSMUST00000077354 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm15204-201ENSMUST00000119454 2281 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 AC125223.2-202ENSMUST00000225020 4103 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Fbxl2-201ENSMUST00000035090 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdca7Q9D0M2 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm18876-201ENSMUST00000219985 1849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Wdr61-202ENSMUST00000118771 3372 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Smok2a-201ENSMUST00000080647 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Zfp740-203ENSMUST00000119800 3882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Mcm10-202ENSMUST00000102985 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Txnip-201ENSMUST00000049093 2795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28757-201ENSMUST00000186638 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28158-201ENSMUST00000188431 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm21823-201ENSMUST00000189122 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28618-201ENSMUST00000189283 567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm29149-201ENSMUST00000191590 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm37442-201ENSMUST00000191915 567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm36978-201ENSMUST00000195734 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdca7Q9D0M2 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms