Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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