Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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