Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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PtprtQ99M80 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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