Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc71Q8VEG0 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms