Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc28aQ8CEI3 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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