Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc17Q8CE13 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc17Q8CE13 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc17Q8CE13 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc17Q8CE13 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc17Q8CE13 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc17Q8CE13 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc17Q8CE13 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc17Q8CE13 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc17Q8CE13 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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