Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp49Q6P9L4 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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