Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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