Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms