Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms