Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms