Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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