Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Rnf149Q3U2C5 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Rnf149Q3U2C5 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Rnf149Q3U2C5 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Rnf149Q3U2C5 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Rnf149Q3U2C5 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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