Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms