Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms