Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
VhlP40338 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms