Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms