Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms