Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms