Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-Eb1P04230 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms