Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Gm28048F7BCN0 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm28048F7BCN0 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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