Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf4Q9QZS2 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms