Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Parp9-202ENSMUST00000114877 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Tro-207ENSMUST00000163969 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm30373-202ENSMUST00000217507 2709 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ccdc36-201ENSMUST00000076592 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr1198-202ENSMUST00000215179 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 CT025642.3-201ENSMUST00000225503 4086 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Atxn1-202ENSMUST00000167708 3751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm38012-201ENSMUST00000193022 3029 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Pde8b-210ENSMUST00000162412 4035 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Rpgr-205ENSMUST00000115533 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm26802-201ENSMUST00000181066 2144 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm43836-201ENSMUST00000196532 381 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm42634-201ENSMUST00000197362 381 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Pcdhb15-201ENSMUST00000050034 2801 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Npy2r-204ENSMUST00000182831 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC120163.1-201ENSMUST00000228618 1680 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Slc25a35-201ENSMUST00000018884 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Cd99l2-203ENSMUST00000114586 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm2233-201ENSMUST00000222566 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms