Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syde1Q9DBZ9 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Syde1Q9DBZ9 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syde1Q9DBZ9 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syde1Q9DBZ9 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Syde1Q9DBZ9 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Syde1Q9DBZ9 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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