Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc47Q9D024 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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