Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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