Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms