Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Atg4aQ8C9S8 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
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Atg4aQ8C9S8 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Atg4aQ8C9S8 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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