Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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