Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms