Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms